Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Gpc6Q9R087 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gpc6Q9R087 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gpc6Q9R087 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gpc6Q9R087 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gpc6Q9R087 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gpc6Q9R087 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gpc6Q9R087 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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