Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms