Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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