Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Nectin3Q9JLB9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nectin3Q9JLB9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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