Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Kcnq4Q9JK97 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Kcnq4Q9JK97 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Kcnq4Q9JK97 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Kcnq4Q9JK97 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Kcnq4Q9JK97 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Kcnq4Q9JK97 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Kcnq4Q9JK97 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Kcnq4Q9JK97 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnq4Q9JK97 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Kcnq4Q9JK97 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms