Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smco4Q9JIS3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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