Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Tspan4Q9DCK3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Tspan4Q9DCK3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tspan4Q9DCK3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tspan4Q9DCK3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tspan4Q9DCK3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tspan4Q9DCK3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tspan4Q9DCK3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tspan4Q9DCK3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tspan4Q9DCK3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tspan4Q9DCK3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Tspan4Q9DCK3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tspan4Q9DCK3 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Tspan4Q9DCK3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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