Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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Smg9Q9DB90 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Smg9Q9DB90 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Smg9Q9DB90 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Smg9Q9DB90 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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