Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd2Q9D1L0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms