Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrs1Q9CYH6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrs1Q9CYH6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms