Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SdhdQ9CXV1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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