Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Chmp3Q9CQ10 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Chmp3Q9CQ10 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Chmp3Q9CQ10 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Chmp3Q9CQ10 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Chmp3Q9CQ10 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Chmp3Q9CQ10 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Chmp3Q9CQ10 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Chmp3Q9CQ10 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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