Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms