Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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