Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r188Q8K3N2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms