Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms