Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CntrobQ8CB62 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms