Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhsl1Q8CAF4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms