Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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