Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zbtb40Q6PCS8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms