Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd1Q61345 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms