Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms