Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Snx27Q3UHD6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Snx27Q3UHD6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Snx27Q3UHD6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Snx27Q3UHD6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Snx27Q3UHD6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Snx27Q3UHD6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Snx27Q3UHD6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Snx27Q3UHD6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Snx27Q3UHD6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Snx27Q3UHD6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx27Q3UHD6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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