Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax1Q2NKI2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vax1Q2NKI2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vax1Q2NKI2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vax1Q2NKI2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Vax1Q2NKI2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vax1Q2NKI2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vax1Q2NKI2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vax1Q2NKI2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vax1Q2NKI2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vax1Q2NKI2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vax1Q2NKI2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax1Q2NKI2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax1Q2NKI2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax1Q2NKI2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax1Q2NKI2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax1Q2NKI2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax1Q2NKI2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax1Q2NKI2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax1Q2NKI2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms