Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Samd11Q1RNF8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Samd11Q1RNF8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Samd11Q1RNF8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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