Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Cpne9Q1RLL3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cpne9Q1RLL3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cpne9Q1RLL3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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