Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rundc1Q0VDN7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms