Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms