Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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