Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms