Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GscQ02591 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms