Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja5Q01231 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms