Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms