Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Scn1bP97952 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Scn1bP97952 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scn1bP97952 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Scn1bP97952 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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