Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms