Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tp53bp1P70399 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tp53bp1P70399 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tp53bp1P70399 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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