Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms