Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl3P58873 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms