Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rad23aP54726 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms