Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Defa6P50704 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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