Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Hoxc13P50207 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Hoxc13P50207 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Hoxc13P50207 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Hoxc13P50207 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Hoxc13P50207 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Hoxc13P50207 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Hoxc13P50207 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Hoxc13P50207 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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