Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myo1bP46735 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo1bP46735 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms