Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptk2P34152 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms