Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 AC123735.1-201ENSMUST00000227358 605 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms