Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Znf239P24399 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Znf239P24399 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Znf239P24399 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms