Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms