Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb2P13373 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms