Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa7P02830 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms