Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptpn20O55082 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms