Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Degs1O09005 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms